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利用非暗培养叶片构建棉花BAC文库的方法专利

时间:2026-10-04    作者:admin 点击: ( 0 ) 次

【摘要】 本发明涉及分子生物学领域,本发明具体涉及利用非暗培养叶片构建棉花BAC文库的方法。所述方法包括步骤:1)棉株叶片的选取;2)高分子量细胞核DNA的提取;3)高分子量DNA的部分消化及两次选择;4)大片段DNA的回收、连接及转化;5)插入片段的检测。该方法适用于构建所有棉花材料的BAC文库,包括种子量少或无种子但宿生保存的棉花材料。 【专利类型】发明授权 【申请人】中国农业科学院棉花研究所 【申请人类型】科研单位 【申请人地址】455000 河南省安阳市开发区黄河大道38号 【申请人地区】中国 【申请人城市】安阳市 【申请号】CN201210215857.6 【申请日】2012-06-28 【申请年份】2012 【公开公告号】CN102747427B 【公开公告日】2014-06-25 【公开公告年份】2014 【授权公告号】CN102747427B 【授权公告日】2014-06-25 【授权公告年份】2014.0 【IPC分类号】C40B50/06; C12N15/10; C12N15/63 【发明人】高海燕; 王坤波; 马峙英; 刘方; 王省芬; 王春英; 张香娣; 王玉红; 彭仁海 【主权项内容】1.利用非暗培养叶片构建棉花BAC文库的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:1)棉株叶片的收集:选用不需要暗处理的棉株的叶片,摘取田间或花盆正常生长、刚平展的幼嫩棉花叶片;2)提取高分子量细胞核DNA,将细胞核包埋在低熔点琼脂糖中,然后裂解释放核DNA,具体步骤如下:取叶片40g,迅速转入液氮中研磨约1h,然后将粉末转入400mL预冷的Washbuffer,配方为:0.08M KCl,0.01M Trizma base,0.01M EDTA Na2,1mM Spermidine,1mM Spermine,0.5M Sucrose,2%PVP40,0.13%DIECA,0.15%β–巯基乙醇和0.5%TritonX-100,冰上轻轻搅拌15-20min,用两层纱布和2层微细滤布过滤到预冷的50mL离心管中,4℃、3200rpm、离心20min,去除上清,如果此次离心沉淀时还有一些绿色沉淀,用毛刷将表层的绿色沉淀轻轻刷出,然后用Wash buffer对沉淀再次悬浮,并且降低离心速度,去除绿色沉淀;向沉淀中加入500μL1×HB,配方为:0.08M KCl,0.01M Trizma base,0.01MEDTA Na2,1mM Spermidine,1mM Spermine,0.5M Sucrose,2%PVP40,0.13%DIECA,0.15%β–巯基乙醇,悬浮沉淀,合并各离心管的悬浮液于一个离心管中,向离心管中加满1×HB混匀,4℃、4000rpm、离心15min,用1×HB重复此步骤3次,最后在沉淀中加入不含β–巯基乙醇的1×HB调整细胞核的浓度,将细胞核悬浮液和1.5%的低熔点琼脂糖于45℃水浴5min,然后两者等体积混匀,45℃水浴5min,迅速将混合液加入plug mold中,冰上冷却30min,待其充分凝固后,将胶块放入含有蛋白酶K的裂解液中,蛋白酶K的浓度为1mg/mL,在50℃杂交炉中裂解36h,中间换一次裂解液,去除裂解液,加入含浓度PMSF的50mL预冷的T10E10,其中PMSF的浓度为1mM,T10E10的配方为10mM Tris-HCl、10mM EDTA,冰上轻轻震荡2次,每次1h,再将胶块放在不含PMSF的T10E1中冰上清洗4次,其中,T10E1的配方为10mM Tris-HCl、1mM EDTA,每次1h,随后将胶块置于T10E1中,4℃保存备用;3)高分子量核DNA的酶切及两次选择,采用脉冲场凝胶电泳分离,对于第一次选择:脉冲的起始时间10s,第一次选择中,脉冲条件为:1%琼脂糖,0.5×TBE缓冲液,11℃,泵70,角度120°,6v/cm,10s-50s,18h,选出120~300kb的DNA片段,分成120~200kb和200~300kb两个范围进行第二次选择,对于第二次选择:起始和终止时间分别为4s-4s,第二次选择中,脉冲条件为:1%琼脂糖,0.5×TBE缓冲液,11℃,泵70,角度120°,6V/cm,电泳时间14h,选出120~200kb和200~300kb的DNA片段;4)分别对存在于胶块中的120~200kb,200~300kbDNA进行回收,与载体连接,然后转化感受态细胞;5)检测阳性克隆的插入片段是否满足实验需要。 【当前权利人】中国农业科学院棉花研究所 【当前专利权人地址】河南省安阳市开发区黄河大道38号 【统一社会信用代码】121000004173473256 【家族被引证次数】6

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