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从小RNA合成的cDNA文库分离出microRNA前体cDNA的方法专利

时间:2026-08-01    作者:admin 点击: ( 0 ) 次

【摘要】 本发明公开了一种从小RNA合成的cDNA文库分离出microRNA前体cDNA的方法,包括以下步骤:将cDNA进行PCR扩增;得到的cDNA片段用5’端带有生物素标记的引物进行PCR扩增,扩增后得到的cDNA双链进行变性处理,然后用磁珠技术进行cDNA双链分离;对分离得到的cDNA单链进行复性,形成具有具有不同二级结构的单链cDNA,分别回收,进行PCR反应形成双链;将PCR片段经限制酶酶切,克隆测序。本发明采用的测序方法能够更为有效地提高miRNA克隆测序的效率。。数据由整理 【专利类型】发明授权 【申请人】南京农业大学 【申请人类型】学校 【申请人地址】210095 江苏省南京市卫岗1号 【申请人地区】中国 【申请人城市】南京市 【申请人区县】玄武区 【申请号】CN201010235667.1 【申请日】2010-07-23 【申请年份】2010 【公开公告号】CN101914524B 【公开公告日】2011-12-21 【公开公告年份】2011 【授权公告号】CN101914524B 【授权公告日】2011-12-21 【授权公告年份】2011.0 【IPC分类号】C12N15/10 【发明人】周波; 刘红林 【主权项内容】1.一种从小RNA合成的cDNA文库分离出microRNA前体cDNA的方法,包括以下步骤:将合成的cDNA进行PCR扩增,扩增后将PCR片段经限制酶酶切,克隆测序,其特征在于:该方法在进行PCR扩增之后、PCR片段酶切之前还需要对所获得的PCR产物进行具有microRNA前体片段的不同二级结构单链分离;所述分离过程包括以下步骤: (1)将得到的cDNA片段用5’端带有生物素标记的引物进行PCR扩增,扩增后得到的cDNA双链进行变性处理,然后用磁珠技术进行cDNA双链分离; (2)对步骤(1)中得到的cDNA单链进行复性,得到具有microRNA前体片段的二级结构的cDNA; (3)通过电泳分离步骤(2)中得到的cDNA,得到具有不同二级结构的单链cDNA,分别回收,进行PCR反应形成双链; 其中步骤(1)中PCR扩增引物为:F:5’-AAAGATCCTGCAGGTGCGTCA-3’,R:5’-GTCTCTAGCCGCAGGATCGATG-3’; 步骤(1)中的cDNA双链变性处理条件为95℃时5min; 步骤(2)中单链复性为在以下条件下依次进行:94℃时2min,60℃时30sec,72℃时1min,4℃时5min; 步骤(3)中电泳分离采用聚丙烯酰胺电泳或二维电泳,电泳结束后银染。 【当前权利人】南京农业大学 【当前专利权人地址】江苏省南京市卫岗1号 【专利权人类型】公立 【统一社会信用代码】12100000466007562R 【引证次数】2.0 【他引次数】2.0 【家族引证次数】2.0 【家族被引证次数】8

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