【摘要】 本发明提供一种预示和鉴定鸡体重和跖骨性状的单倍体型标记方法。根据鸡1号染色体基因组序列，查找到在173196313bp、173239127bp、173306996bp和173492453bp处存在四个SNP，根据这四个SNP两侧基因组序列分别设计四对引物，用这四对引物对鸡基因组DNA进行PCR扩增；分别用限制性内切酶MspI、MboI、XbaI和Eco72I消化扩增的PCR产物；用2％的琼脂糖凝胶对消化后的PCR产物进行电泳分离，获得基因型后构建单倍型。结果发现所有12只F1公鸡母源的染色单体共享一个单倍体型即A－C－F－H，相关分析表明，具有共享单倍体型个体的体重和跖骨性状显著低于其他单倍体型个体。 ： 【专利类型】发明申请 【申请人】东北农业大学 【申请人类型】学校 【申请人地址】150030黑龙江省哈尔滨市香坊区木材街59号 【申请人地区】中国 【申请人城市】哈尔滨市 【申请人区县】香坊区 【申请号】CN200810064787.2 【申请日】2008-06-20 【申请年份】2008 【公开公告号】CN101307358A 【公开公告日】2008-11-19 【公开公告年份】2008 【IPC分类号】C12Q1/68 【发明人】李辉; 张慧; 王守志 【主权项内容】1、一种预示和鉴定鸡体重和跖骨性状的单倍体型标记方法，步 骤如下： (1)根据鸡SNP1、SNP2、SNP3和SNP4附近的基因组序列分 别设计四对引物： SNP1F：5’-GTGTTTATCAGCACGAGCC-3’ SNP1R：5’-CAGGAACTGTCAAGGTGGG-3’； SNP2F：5’-AGAAAGCCACTATCAAGAAC-3’ SNP2R：5’-TTGGGTGTCAACAAGGAT-3’； SNP3F：5’-GAAGTGAGGGTGTTGGAGAC-3’ SNP3R：5’-GAGCAGGTGAGTTTCAAATAGG-3’； SNP4F：5’-CTTCAAAGTGCTCCTATCCC-3’ SNP4R：5’-GTGGTATTACTTGTGGGAGC-3’； (2)利用这4对引物对鸡的基因组DNA进行PCR扩增，PCR 扩增片段长度依次分别为658bp、403bp、481bp和582bp； (3)利用限制性内切酶MspI、MboI、XbaI和Eco72I分别消化 扩增的PCR产物； (4)使用2％的琼脂糖凝胶对消化后的PCR产物进行电泳分离， 检测出SNP1的G＞A变异位点、SNP2的A＞G变异位点、SNP3的 T＞C变异位点和SNP4的C＞T变异位点； (5)当鸡SNP1中变异位点为G碱基时，会产生限制性内切酶 MspI的酶切位点C/CGG，MspI消化PCR产物后会产生2个片段 423bp和235bp，将其命名为BB基因型；该位点为A碱基时CCGA， 则不存在MspI酶切位点，MspI消化PCR产物后只有1个片段658bp， 将其命名为AA基因型；该位点为G/A杂合时，MspI消化PCR产物 后会产生3个片段658bp、423bp和235bp，将其命名为AB基因型； 与此类似将SNP2变异位点的三种基因型分别命名为CC、CD和DD； SNP3的基因型命名为EE、EF和FF；SNP4的基因型命名为GG、 GH和HH。 ： 【当前权利人】东北农业大学 【当前专利权人地址】黑龙江省哈尔滨市香坊区木材街59号 【专利权人类型】公立 【统一社会信用代码】122300004140017248 【被引证次数】16 【被自引次数】2.0 【被他引次数】14.0 【家族被引证次数】16

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